La causa más frecuente de hepatitis crónica es la infección persistente por un virus hepatotropo. Los únicos capaces de causar hepatitis crónica son el virus de la hepatitis B (VHB), el de la hepatitis C (VHC) y el de la hepatitis D (VHD). Causas menos frecuentes de hepatitis crónica son reacciones de carácter autoinmune, la toxicidad por alcohol o por fármacos y la enfermedad de Wilson (o degeneración hepatolenticular).