La Enfermedad de Crohn tiene un riesgo aumentado 6 veces de cáncer en intestino delgado y entre 4-20 veces para el de localización en colon.

La zona de mayor incidencia corresponde al ileon a diferencia de los primitivos que suelen ser de duodeno o yeyuno proximal. Es frecuente que afecten a asas desfuncionalizadas, bien por fístulas entero-entéricas espontáneas o por técnicas de cirugía derivativa para evitar estenosis. Actualmente tienden a realizarse estricturoplastias (estenoplastias) precisamente para evitar este riesgo. El diagnóstico de esta complicación es especialmente difícil y una vez establecido su pronóstico es malo, con una mortalidad global del 82% a los 5 años y un promedio de supervivencia de 7.8 meses.

De la Morena EJ, Iborra J, Abreu L. La displasia en la enfermedad inflamatoria intestinal : el punto de vista del clínico. En : Abreu L, Chantar C. Enfermedad Inflamatoria Intestinal. Prous Eds. Madrid 1990.